扬州市皮肤病性病防治所始建于1975年，是直属于扬州市卫生局的全额预算管理卫生单位。
1987年10月，为适应医疗体制改革的需要，对外开设皮肤病性病门诊部，提供医疗服务，并以皮肤病、性病专科建设为重点，带动相关专科的全面发展。
1995年，为满足社区群众对皮肤病、性病医疗服务的需求，该所在秋雨西路13号设立了第二门诊部，取得了较好的社会效益和经济效益。
在门诊事业的发展过程中，该所始终坚持将人才建设和科技建设放在首位，深挖内部潜力，不断加大科技投入，经过十几年的不懈努力，医技人员已由建所初期的3人增至16人，其中副主任医师4人，主治医师6人。拥有多种市内、省内领先的检测及治疗设备，按照GMP标准改造一新的皮肤科外用制剂室生产的二十余种皮肤科外用制剂，以其独特的疗效深得广大患者的欢迎。雄厚的技术力量，一流的服务质量，舒适的就诊环境，使该所的社会影响力远远超出了扬州市的辖区范围，很多市外病人慕名前来就诊。